西安航天神舟建筑設計院隸屬于中國航天科技集團公司第四研究院，成立于1984年10月，當時單位名稱為航天工業部第四研究院建筑設計室，1997年7月更名為中國航天工業總公司第四研究院建筑設計所，2001年12月更名為西安航天神舟建筑設計院。
    1992年我院取得中國航天工業總公司頒發的航天工程、建筑工程、市政工程丙級設計資質；1997年取得建設部頒發的軍工工程、建筑工程乙級設計資質；2000年取得國家發改委頒發的工程咨詢甲級資質；2002年取得陜西省建設廳頒發的城市規劃丙級設計資質；2003年質量體系通過陜西方圓認證中心ISO9001-2002認證審核；2005年通過軍工保密資格二級認證審核。2008年取得中華人民共和國建設部頒發的建筑行業建筑工程甲級和軍工行業（航天空間飛行器、導彈及火箭彈）甲級設計資質；2008年取得工程建設招標代理資質。2011年取得防雷工程乙級設計資質。
    2001年成立北京分院，到目前為止北京分院已相對獨立的開展設計、咨詢工作。